河北医科大学第三医院肛肠专业成立于1985年，1990年独立建科，本着“务实图强、开拓创新”的科训宗旨，经过几代肛肠专科医护人员的不懈努力，在历任院领导关怀下，肛肠外科专业有了长足发展。于2011年10月又划分为肛肠一科（即肛肠外科）和肛肠二科（便秘科）。肛肠外科历经30余年发展，逐渐成为集临床、科研、教学和预防为一体的肛肠外科专业化科室。开展结直肠癌、便秘、炎性肠病、痔瘘裂等肛周疾病诊疗，在省内享有盛誉。1992年河北省中西医结合大肠肛门病专业委员会依托该科而成立，2001年经河北省科技厅、河北省卫生厅批准该科设立为“河北省大肠肛门病研究中心”。2013年依托我科成立河北省中西医结合学会大肠病专业委员会，2016年再次依托我科成立河北省中西医结合盆底疾病专委会。为进一步提升我院外科专业水平，向省内重点学科迈进，于2020年4月7日科室实现专业合并优化，成立胃肠外科。扩大胃肠疾病的收治范围，扩大胃肠疾病的收治范围，提高诊疗质量。